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類器官模型正在成為人生理學和病理生理學研究的重要系統。然而,目前該領域仍缺乏綜合的實驗與計算方法來對類器官的發育進行跨空間及時間尺度的表征測量。瑞士巴塞爾羅氏創新中心人類生物學研究所等機構分析研究了人視網膜類器官發育的多模態時空表型。該研究成果于近日發表在《Nature Biotechnology》雜志上,題為:Multimodal spatiotemporal phenotyping of human retinal organoid development。
研究人員開發了一種分析細胞及組分的新方法,稱為迭代間接免疫熒光成像(iterative indirect immunofluorescence imaging, 4i)。他們證明了該方法能夠解析細胞類型、形態結構、細胞器和蛋白質定位,進而可以分析基因表達以外的空間特征。他們將該方法應用于人視網膜類器官生成了多模態圖譜,描述了整個39周視網膜類器官的發育。結合單細胞轉錄組和染色質可及性時間序列數據集,推斷出類器官發育的基因調控網絡。
該研究顯示,在發育中的類器官組織上進行4i分析是一種具有高分辨率、有效及可重復的方法。該方法可用于對細胞樣本和規模的異質性進行分析。
注:此研究成果摘自《Nature Biotechnology》雜志,文章內容不代表本網站觀點和立場,僅供參考。
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責任編輯:Rex_05